Il y a 150 ans une tempête magnétique a balayé la terre, divisant celle-ci en deux mondes. Les Territoires sains, ayant échappé aux radiations, et les Territoires irradiés. Un bouclier magnétique a été érigé par le Commandement Suprême pour empêcher tout contact avec les territoires irradiés et éviter à la population des territoires sains toute contamination par irradiation. La moitié des habitants des territoires irradiés a survécu, mais certains d’entre eux ont subi des mutations génétiques, ainsi que leur descendance.
Aura, fille d’un gouverneur responsable d’un poste avant frontière (aux territoires irradiés) élève au prestigieux Collège, réservé aux enfants des gouvernants, apprend qu’une deuxième tempête se prépare, et que le Commandement Suprême s’apprête en secret à évacuer une partie de ses habitants dans des vaisseaux placés en orbite autour de la terre afin d’échapper à cette nouvelle menace.
Aura découvre par son oncle Sirius qu’un réseau secret s’est crée entre les deux mondes afin de parvenir à leur réunification. Mais les gouvernants en place de chaque côté, Commandement Suprême pour les territoires sains, et Etat Major pour les territoires irradiés n’ont aucun intérêt à celle-ci. Aura accepte d’espionner pour le compte du réseau et tombe amoureuse d’Adam, le fils d’un des membres de l’Etat Major, qui appartient également au Réseau.
La seconde tempête va cette fois-ci épargner les territoires irradiés et s’abattre sur les territoires sains. Contre toute attente, l’Etat Major va profiter de cette tempête afin d’annexer tous les territoires de la terre alors que le Commandement Suprême s’est réfugié dans ses vaisseaux, ne disposant plus alors sur terre que de sa base arrière, la Mégalopole, protégée par un bouclier anti radiation.

Storm II est passée en épargnant les Territoires irradiés. La population des Territoires Sains se retrouve confinée sur la Mégalopole et dans les vaisseaux en orbite. Le Commandement Suprême se retrouve confrontée au soulèvement des personnes déplacées, pendant que dans l’ombre, l’Etat Major avance ses pions afin de faire tomber son rival. Aura, désormais isolée, va devoir faire face aux évènements, en confrontant son passé, mais également à la trahison et au sacrifice de certains des siens.