2076, le monde est envahi par la technologie où les mégacorporations sont prédominantes.
Un Garçon et une fille orphelins, non liés par le sang, sont recueillis et élevés par un scientifique qu’ils nomment « Père ». Pendant des années, il passe sa vie à créer secrètement des implants qu’il teste sur ses « enfants ».
Les trois ressemblent à une famille heureuse jusqu’au jour, où les Ghost, une milice contre la cybercriminalité débarque chez eux pour les arrêter. Les enfants tentent de fuir, mais c’est déjà trop tard, leur « Père » est abattu.
Pour sauver la fille, le Garçon l’enfermera dans une cachette et le dernier mot qu’elle entendra est : Ran, du mot « Run », qui deviendra son prénom.
Dix ans plus tard, Ran a vingt-ans, elle tente de survivre dans ce monde chaotique.
Persuadée que le Garçon avec qui elle a vécu n’est pas mort, elle le cherchera durant tout ce temps sans avoir aucune information sur ce Garçon devenu fantôme.
Mais un jour, lors d’une bagarre qui tourne mal dans les rues de Minport City, Ran est piégée par les Ghost.
Elle reconnaîtra immédiatement le « Garçon » devenu homme et soldat de la milice, à qui les souvenirs ont été totalement effacés.
Il est prêt à la tuer. Elle est prête à le fuir.